Я разделил бы задачу на 3 части.
1. Какие источники энергии были доступны в то время.
Мускулы людей и животных.
Течение реки
Сила ветра
Огонь
2. Какие механизмы использовались в древности для подобных целей.
Винт Архимеда
Подъемник для колодца "Журавль"
Подъемник для колодца с воротом
Водоподъемное колесо
Цепной или веревочный подъемник.
3 что из современных водяных насосов возможно использовать в 12 веке.
Поршневой ручной насос (как на огороде)
перестатический насос
Возможно изготовление примитивной паровой машины.
Возможно изготовление парового водоподъемного устройства ( наполовину заполненный водой сосуд подается пар, пар вытесняет воду, вода по трубке идет вверх)
http://stomaster.livejournal.com/2400027.html